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斑馬魚胚胎/魚苗分析軟體 DanioScope

產品型號: DanioScope
廠牌名稱: Noldus
DanioScope是Noldus最近開發的一套針對斑馬魚研究量身訂做的軟體,用來觀察與分析斑馬魚的胚胎與魚苗,可以進行分析的參數包括活動力、心臟血流相關參數與形態觀察,並可利用影像與圖片檔案進行分析。

產品特點

DanioScope 讓您能夠同時測試多個動物。這顯著提高了您的研究通量,並最終在準備實驗、採集數據和分析結果方面為您節省大量時間。

 

DanioScope 的特色

 

在數據採集後,DanioScope 提供多種選項來選擇、視覺化和分析數據。您也可以輕鬆匯出原始數據,以便在您選擇的統計程式中進行進一步分析。DanioScope 適用於支援高速影片(超過 60 fps),並且可以處理多種影片格式。

 

軟體功能

 

此軟體具有多項功能,能讓您更輕鬆地設定和執行實驗:

  • 結合多個測量: 可同時測量多種參數。

  • 批次採集: 支援批次處理影片,提高效率。

  • 輕鬆的實驗管理和組織: 方便管理和組織您的實驗數據。

  • 靈活的數據選擇、分組和顯示: 讓您能以多種方式篩選、分組和呈現數據。

  • 可重新定義閾值以微調結果: 允許您調整閾值,以獲得更精確的分析結果。

 

您可以測量的參數

 

  • 胚胎活動: 斑馬魚發育迅速,在幾個小時內內部器官就開始發育。受精後最早 17 小時,尾部輕彈、盤繞和痙攣等行為就會開始出現。這些行為在毒理學和藥理學研究中特別受關注,因為它們反映了神經系統的發育,並且這些讀數對藥理學操縱高度敏感。DanioScope 能夠非侵入性地測量這些行為。只需使用一個或多個斑馬魚胚胎的影片,DanioScope 會自動識別每個胚胎(在它們的絨毛膜內)並測量其活動。如果發生漂浮,您可以在實驗期間調整測量位置。DanioScope 會回報以下參數:

    • 突發活動 (Burst activity): 胚胎處於活動狀態的時間佔總測量時間的百分比。

    • 非活動 (Inactivity): 胚胎處於非活動狀態的時間百分比(100% 減去突發活動)。

    • 突發持續時間 (Burst duration): 處於活動狀態的總時間(所有運動持續時間的總和)。

    • 非活動持續時間 (Inactivity duration): 處於非活動狀態的總時間。

    • 突發計數 (Burst count): 胚胎移動的次數。

    • 每分鐘突發計數 (Burst count / per minute): 每分鐘移動的次數。

 

  • 斑馬魚幼魚的心臟學: 心臟是斑馬魚第一個發育的器官,其發育與人類心臟相似,這兩點都讓斑馬魚成為心臟病學研究中一個有趣的模式。

    斑馬魚心臟系統的評估是透過測量心率或心跳間隔來進行。傳統方法包括手動計數(使用碼表)、使用微壓力系統、雷射都卜勒顯微鏡或心電圖。這些方法勞動密集、耗時,且需要特定的培訓才能執行。

    基於影片的心率和心跳間隔評估則省力得多。在 DanioScope 匯入的影片中指定心臟區域後,它會自動計算每秒心跳數 (BPS) 和每分鐘心跳數 (BPM)。

 

  • 血液和腸道流動: 心臟功能障礙不一定總能在心率數據中顯現。在這種情況下,血流測量是對研究的寶貴補充。

    血流可以透過手動計數方法進行測量,這通常需要勞動密集且耗時的螢光標記技術。DanioScope 使用影片分析來測量血管中的血流,並以類似的方式測量腸道流動。

    要測量流動,您只需在影片圖像中選擇(部分)從壁到壁的血管或腸道區域。該軟體會透過逐幀分析像素的變化來測量流動,並將血液或腸道流動以活動百分比呈現。

 

  • 形態學測量: 除了動態測量,DanioScope 也讓您能夠輕鬆監測斑馬魚的形態學。您可以上傳圖片或從影片中截圖來監測形態學的變化。

    透過直觀的繪圖工具,您可以定義您感興趣的距離或區域。校準後,DanioScope 會自動測量長度和表面積。這樣您就可以輕鬆確定尾巴長度、眼睛大小和心包區域,或任何其他由您自行定義的測量項目!

    使用不同時間點的圖像,您可以輕鬆監測生長和畸形的隨時間變化。

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